Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms