Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms