Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms