Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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