Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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