Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg3Q9CPX6 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms