Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms