Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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