Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms