Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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NipblQ6KCD5 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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NipblQ6KCD5 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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