Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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