Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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