Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prdm10Q3UTQ7 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prdm10Q3UTQ7 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prdm10Q3UTQ7 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms