Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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