Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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