Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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