Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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