Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TP20293 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TP20293 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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