Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms