Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Cbr1-201ENSMUST00000039659 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm29367-201ENSMUST00000190911 1327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Ssb-201ENSMUST00000090852 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm20538F6Z9R1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms