Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm340F6RGI3 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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