Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Clrn2B2RVW2 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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