Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprbB2RU80 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms