Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rb1cc1Q9ESK9 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rb1cc1Q9ESK9 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rb1cc1Q9ESK9 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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