Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms