Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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