Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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