Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms