Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.5 ms