Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Fam20bQ8VCS3 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms