Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Top1mtQ8R4U6 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Top1mtQ8R4U6 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Top1mtQ8R4U6 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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