Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms