Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Atg4aQ8C9S8 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Atg4aQ8C9S8 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg4aQ8C9S8 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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