Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms