Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg9aQ68FE2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms