Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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