Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
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