Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Znf48Q3US17 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Znf48Q3US17 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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