Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp19Q3UJD6 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp19Q3UJD6 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp19Q3UJD6 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Usp19Q3UJD6 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Usp19Q3UJD6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms