Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Siah1bQ06985 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.8 ms