Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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