Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms