Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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PtprmP28828 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
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PtprmP28828 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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PtprmP28828 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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PtprmP28828 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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