Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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