Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms