Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms