Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smim3Q99PE5 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms