Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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