Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms