Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ChfrQ810L3 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms